Karena LAPAN-TUBSAT akan diluncurkan oleh PSLV, maka kekuatan struktur yang harus dipenuhi adalah mampu menahan beban dari masa komponenya yang yang mengalami percepatan 7 g ke arah longitudinal roket dan 6 g kearah lateral roket. Juga struktur tersebut harus mempunyai frekwensi resonansi terendah diatas 90 Hz kearah longitudinal roket dan diatas 45 Hz ke arah lateral roket. Selain memenuhi persyaratan yang tersebut diatas, pada kasus LAPAN-TUBSAT desain struktur juga dibuat agar satelit mempunyai momen inersia maximum pada axis Y dan sekecil mungkin insersia cross productnya. Sehingga nutasi dapat diminimalkan saat satelit mengadakan transfer momentum sudut. Agar dapat memaximalkan akses terhadap seluruh komponen satelit, sehingga memudahkan sistem harness, maka struktur LAPAN-TUBSAT dibuat dengan sistem 2 kompartemen yang saling membelakangi, yang disebut sebagai kompartemen bawah dan atas sesuai dengan penempatannya di roket kelak. Panjang kompartemen bawah dibuat untuk terutama mengakomodasi komponen yang paling panjang, yakni kamera Sony dengan lensa Casegrain 11/1000 mm. Lebarnya akan dibuat sama dengan panjangya agar distribusi inersia ke sumbu X dan Z hampir sama. Tinggi kompartemen bawah disesuaikan dengan tinggi lensa plus platform peredam kejutnya. Sementara tinggi kompartemen atas dibuat pas untuk memuat baterai dengan sistem mountingnya. Penempatan baterai pada sisi yang berlawanan dengan platform kamera Sony adalah untuk mengimbangi beratnya, sehingga lokasi pusat masa dapat memenuhi persyaratan PSLV. Sehingga, kedua kompartemen membentuk sebuah box dengan ukuran 450 x 450 x 275 mm. Konfigurasi ini terbuat dari 7 plat alumunium dengan tebal 10 mm. Ketebalan ini diperlukan agar momen inersia maximum pada axis Y didapat dan struktur dapat menghantarkan panas (conduction) dengan baik dari sisi yang terkena radiasi matahari dan dari komponen yang menghasilkan panas (seperti transmiter dan gyro) ke sisi lain. Untuk lebih maximalkan sifat termal struktur (radiasi/absorpsi panas), maka plat alumunium tersebut dihitamkan dengan anodizing. Komponen berat lain yang dipakai untuk mengkompensasi berat platform kamera Sony adalah Reaction Wheels, yang dipasang berseberangan dengan kamera di kompartemen bawah mendekati sisi minus Z. Untuk meminimalkan panjang harnessnya seluruh komponen ACS (gyro, wheel drive electronic) ditempatkan pada bagian tersebut. Untuk alasan yang sama pula, S-band transmiter, diletakkan mendekati S-band antena pada sisi plus Z dan TTC1 mendekati UHF antena pada sisi minus X. Tempat yang tersisa pada kompartemen bawah diperuntukkan bagi star sensor yang perlu mempunyai field of view keluar satelit namun tidak mengarah ke bumi. Kamera Kappa dengan 50 mm lensa ditempatkan di kompartemen atas menghadap ke sisi plus Z yang didedikasikan untuk melihat bumi. Kemudian air coil Y yang membutuhkan area loop maksimal ditempatkan disepanjang sudut kompartemen atas, sementara 2 air coil lain ditempatkan secara orthogonal melalui kedua kompartemen. Tempat yang tersisa di kompartemen atas dialokasikan untuk TTC2 dan PCDH.

Gambar-1(a) Kompartemen Atas.

Gambar-1(b) : Kompartemen Bawah